导语

  

内容提要

  

    鲁道夫·巴兰古，约翰·范德奥斯特主编的《CRISPR-Cas--RNA介导的细菌和古细菌中适应性免疫系统》对近年来发现的存在于细菌和古细菌中的适应性免疫系统-CRISPR系统进行了全视角系统阐释。描述了CRISPR-Cas系统的整体变异性、多样性特征，以及利用这种变异性描绘菌种之间的系统发育关系。通过对CRISPR-Cas系统中cas基因组进行比较分析，提供了不同CRISPR-Cas类型（Ⅰ，Ⅱ和Ⅲ型）的级联复合物结构的精细模型。讨论了基于CRISPR免疫应答的调控机制和CRISPR-Cas系统防御侵袭基因组关键要素crRNA的生物合成机制。阐释了CRISPR-Cas的细菌细胞毒性作用以及在不同工业和生物技术、基因组编辑等领域的多种应用。最后阐明了CRISPR作用机制的分子基础和微生物群落背景下的CRISPRs系统。
    本书适合生命科学、医学、环境科学、食品加工、农业和畜牧（渔）业等相关专业领域的人士阅读，特别是对应用CRISPR-Cas9基因组编辑技术的相关科研领域的研究人员有极高的参考价值。

序
原著前言
第1章  CRISPR的发现和重要发展
  1.1  概述
  1.2  早期突破
    1.2.1  规律间隔重复序列
    1.2.2  分枝杆菌中的同向重复序列
    1.2.3  嗜盐古菌中的TREPs
    1.2.4  原核微生物重复序列新家族
    1.2.5  古细菌和细菌中CRISPR序列的分布
    1.2.6  加工的CRISPR转录物的发现
    1.2.7  CRISPR相关蛋白的鉴定
  1.3  CRISPR-Cas系统的功能
    1.3.1  早期假设
    1.3.2  CRISPR与入侵遗传元件的关系
    1.3.3  CRISPR系统的功能多样性
  1.4  基于CRISPR系统的功能元件
    1.4.1  CRISPR相关蛋白（Cas）
    1.4.2  CRISPR序列
    1.4.3  前导区
    1.4.4  重复序列
    1.4.5  间隔序列
    1.4.6  前间隔区毗邻基序
    1.4.7  CRISPRRNAs
  1.5  反馈
第2章  CRISPR-Cas系统的形成、多样性和基因分型意义
  2.1  概述
  2.2  评估CRISPRs的整体多样性
    2.2.1  生物信息学工具
    2.2.2  在已公布的基因组中发现的CRISPRs多样性
  2.3  CRISPRs多态性用于基因分型的历史案例
    2.3.1  为什么需要以及如何进行种内分型
    2.3.2  种内CRISPR变异
    2.3.3  复杂微生物组中CRISPR多样性的后续研究
  2.4  讨论
第3章  CRISPR-Cas系统的进化与分类和Cas蛋白家族
  3.1  概述
  3.2  CRISPR-Cas系统的分类
  3.3  Cas蛋白家族
    3.3.1  Cas 1和Cas 2：在间隔区获得中发挥作用的Cas特征蛋白
    3.3.2  HD结构域：干扰所需的单链特异性DNAse
    3.3.3  级联相关性蛋白
    3.3.4  RAMPs的三大家族
    3.3.5  CRISPR-Cas操纵子中RAMP基因的特征性排列
    3.3.6  各种Ⅰ型和Ⅲ型CRISPR-Cas系统的大小亚基之间推测的同源性
    3.3.7  Ⅱ型CRISPR-Cas系统和Cas9同源物
    3.3.8  关于CRISPR-Cas系统起源和进化的假设
    3.3.9  结论
第4章  基于CRISPR的免疫应答调控
第5章  crRNA的生物合成
第6章  Ⅰ型CRISPR-Cas系统的分布与机制
第7章  Ⅱ型CRISPR-Cas系统的生物与遗传特性
第8章  Ⅲ型CRISPR-Cas系统和CRISPR-Cas的细菌毒性作用
第9章  应用CRISPR-Cas系统研究生态多样性和宿主-病毒相互作用
第10章  CRISPR在生理过程调控中的作用
第11章  多功能CRISPR-Cas系统的应用
第12章  微生物群落背景下的CRISPRs
术语词汇表
索引
后记